Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NLRP13Q86W25 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NLRP13Q86W25 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NLRP13Q86W25 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NLRP13Q86W25 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NLRP13Q86W25 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms