Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCA5Q86VQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCA5Q86VQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5Q86VQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5Q86VQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms