Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PACS2Q86VP3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PACS2Q86VP3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PACS2Q86VP3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PACS2Q86VP3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms