Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD163Q86VB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD163Q86VB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD163Q86VB7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms