Protein–RNA interactions for Protein: Q86V86

PIM3, Serine/threonine-protein kinase pim-3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM3Q86V86 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIM3Q86V86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIM3Q86V86 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIM3Q86V86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIM3Q86V86 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms