Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZD3Q86UT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZD3Q86UT5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD3Q86UT5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD3Q86UT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms