Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRC3Q7RTR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NLRC3Q7RTR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLRC3Q7RTR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC3Q7RTR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.4 ms