Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HS2ST1Q7LGA3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS2ST1Q7LGA3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms