Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 516.31■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 29.2
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SND1Q7KZF4 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 29.2
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SND1Q7KZF4 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 29.2
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SND1Q7KZF4 SERPINA5-201ENST00000329597 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.593e-13■■■■■ 28.8
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SND1Q7KZF4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.017e-8■■■■■ 28.8
SND1Q7KZF4 TSPAN31-209ENST00000549052 1100 ntTSL 314.96□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 28.8
SND1Q7KZF4 TSPAN31-212ENST00000552816 582 ntTSL 414.96□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 28.8
SND1Q7KZF4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 28.8
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SND1Q7KZF4 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 28.8
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