Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf47Q6ZRZ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf47Q6ZRZ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9orf47Q6ZRZ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms