Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD1Q6UXZ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD1Q6UXZ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD1Q6UXZ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.8 ms