Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRSAM1Q6UWE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRSAM1Q6UWE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRSAM1Q6UWE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms