Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6Q795 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6Q795 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6Q795 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6Q795 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q6Q795 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q6Q795 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q6Q795 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q6Q795 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q6Q795 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q6Q795 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6Q795 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6Q795 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6Q795 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q6Q795 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6Q795 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6Q795 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6Q795 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6Q795 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6Q795 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q6Q795 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6Q795 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6Q795 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6Q795 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6Q795 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6Q795 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6Q795 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6Q795 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6Q795 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6Q795 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6Q795 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms