Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAVIN1Q6NZI2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CAVIN1Q6NZI2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAVIN1Q6NZI2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms