Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM198Q66K66 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM198Q66K66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM198Q66K66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM198Q66K66 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM198Q66K66 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM198Q66K66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms