Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CHIC1Q5VXU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CHIC1Q5VXU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CHIC1Q5VXU3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
CHIC1Q5VXU3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CHIC1Q5VXU3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms