Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1A1P5Q5VTE0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms