Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO4Q5TGY1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO4Q5TGY1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO4Q5TGY1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms