Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LDLRAD1Q5T700 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LDLRAD1Q5T700 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LDLRAD1Q5T700 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LDLRAD1Q5T700 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDLRAD1Q5T700 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms