Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDSS1Q5T2R2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDSS1Q5T2R2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDSS1Q5T2R2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms