Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TAF1BQ53T94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1BQ53T94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms