Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIPR1Q53HC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIPR1Q53HC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIPR1Q53HC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms