Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC153Q494R4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC153Q494R4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC153Q494R4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms