Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PROX2Q3B8N5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PROX2Q3B8N5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PROX2Q3B8N5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PROX2Q3B8N5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms