Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL38Q2WGJ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL38Q2WGJ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms