Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMN1Q16637 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMN1Q16637 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms