Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11BQ15907 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11BQ15907 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB11BQ15907 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms