Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFKBIBQ15653 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIBQ15653 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms