Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB35Q15286 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB35Q15286 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB35Q15286 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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