Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB3GAP1Q15042 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAB3GAP1Q15042 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB3GAP1Q15042 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB3GAP1Q15042 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
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