Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCA4Q14CN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLCA4Q14CN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms