Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM39Q14498 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM39Q14498 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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