Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSLNQ13421 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSLNQ13421 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MSLNQ13421 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MSLNQ13421 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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