Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDCLQ13371 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCLQ13371 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCLQ13371 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCLQ13371 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms