Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRSQ13332 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRSQ13332 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRSQ13332 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRSQ13332 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
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