Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENBP1Q13228 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENBP1Q13228 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SELENBP1Q13228 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENBP1Q13228 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENBP1Q13228 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENBP1Q13228 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENBP1Q13228 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENBP1Q13228 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SELENBP1Q13228 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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