Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNIP3Q12983 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BNIP3Q12983 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP3Q12983 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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