Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 RGT2YDL138W 2292 nt6.76□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 HSM3YBR272C 1443 nt6.76□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 FCY22YER060W-A 1593 nt6.76□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 TOS2YGR221C 1869 nt6.76□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 SKY1YMR216C 2229 nt6.76□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 GPA1YHR005C 1419 nt6.76□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 YHR020WYHR020W 2067 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 ADE17YMR120C 1779 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 VTS1YOR359W 1572 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 DOT1YDR440W 1749 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 CYS4YGR155W 1524 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 PRP2YNR011C 2631 nt6.75□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 PPH22YDL188C 1134 nt6.74□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.74□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 COX16YJL003W 357 nt6.74□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 OPI11YPR044C 354 nt6.74□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 HED1YDR014W-A 489 nt6.73□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 FMO1YHR176W 1299 nt6.73□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 ASF1YJL115W 840 nt6.73□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 IRC11YOR013W 471 nt6.73□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 HGH1YGR187C 1185 nt6.72□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 OPI8YKR035C 642 nt6.72□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 LSC1YOR142W 990 nt6.72□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 COQ1YBR003W 1422 nt6.72□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 ERG12YMR208W 1332 nt6.72□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 NTE1YML059C 5040 nt6.72□□□□□ -1.33
LDB17Q12342 DFR1YOR236W 636 nt6.71□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 CLN1YMR199W 1641 nt6.71□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 BDF2YDL070W 1917 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 STT3YGL022W 2157 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 GPD1YDL022W 1176 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 LCL3YGL085W 825 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 RNH1YMR234W 1047 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 YOR111WYOR111W 699 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 MRPL23YOR150W 492 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 NME1NME1 340 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 EMP65YER140W 1671 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 PPM2YOL141W 2088 nt6.7□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 ARP3YJR065C 1350 nt6.69□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 ECM38YLR299W 1983 nt6.69□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 ECM30YLR436C 3825 nt6.69□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 PEX31YGR004W 1389 nt6.69□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 GFA1YKL104C 2154 nt6.68□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 RPL5YPL131W 894 nt6.68□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 EHD3YDR036C 1503 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 HIS1YER055C 894 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 HSP12YFL014W 330 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 YKL102CYKL102C 306 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 GCN3YKR026C 918 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 SUR7YML052W 909 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 COX10YPL172C 1389 nt6.67□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 MIA40YKL195W 1212 nt6.66□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 MET8YBR213W 825 nt6.66□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 SAL1YNL083W 1485 nt6.66□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 MRPL35YDR322W 1104 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 DYS1YHR068W 1164 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 CTF8YHR191C 402 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 DID2YKR035W-A 615 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 TAF9YMR236W 474 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 YNL092WYNL092W 1203 nt6.65□□□□□ -1.34
LDB17Q12342 MRPS18YNL306W 654 nt6.64□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 RFC4YOL094C 972 nt6.64□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 YHK8YHR048W 1545 nt6.64□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 GCG1YER163C 699 nt6.63□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 YRB2YIL063C 984 nt6.63□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 ATG36YJL185C 882 nt6.63□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 TOS6YNL300W 309 nt6.63□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 SGE1YPR198W 1632 nt6.63□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 AIM3YBR108W 2844 nt6.62□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 GLN3YER040W 2193 nt6.62□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 FPR2YDR519W 408 nt6.61□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 YKR032WYKR032W 315 nt6.61□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 YPL257WYPL257W 582 nt6.61□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 YPR204WYPR204W 3099 nt6.61□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 EDE1YBL047C 4146 nt6.61□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 HEM1YDR232W 1647 nt6.61□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 DAL4YIR028W 1908 nt6.6□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 ERG8YMR220W 1356 nt6.6□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 FAL1YDR021W 1200 nt6.6□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 YDR415CYDR415C 1125 nt6.6□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 OM45YIL136W 1182 nt6.6□□□□□ -1.35
LDB17Q12342 CUE4YML101C 354 nt6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms