Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 UTR2YEL040W 1404 nt7.76□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 YLL056CYLL056C 897 nt7.75□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 PTH2YBL057C 627 nt7.75□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 MRPL19YNL185C 477 nt7.75□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 ERG10YPL028W 1197 nt7.75□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 YPR204WYPR204W 3099 nt7.75□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 YLR162WYLR162W 357 nt7.74□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 TMA46YOR091W 1038 nt7.74□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 MSC3YLR219W 2187 nt7.74□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 THI2YBR240C 1353 nt7.73□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 ICS3YJL077C 396 nt7.73□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 CST26YBR042C 1194 nt7.73□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 YBR113WYBR113W 483 nt7.73□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 NMD5YJR132W 3147 nt7.73□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 COQ1YBR003W 1422 nt7.72□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 SGE1YPR198W 1632 nt7.72□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 RPP1YHR062C 882 nt7.72□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 SQT1YIR012W 1296 nt7.72□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 MIA40YKL195W 1212 nt7.72□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 KSH1YNL024C-A 219 nt7.72□□□□□ -1.17
LSP1Q12230 MSY1YPL097W 1479 nt7.71□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YUR1YJL139C 1287 nt7.71□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.71□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 DOT1YDR440W 1749 nt7.71□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 KNS1YLL019C 2214 nt7.71□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YML079WYML079W 606 nt7.7□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YNL092WYNL092W 1203 nt7.7□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YNL120CYNL120C 486 nt7.7□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 DFR1YOR236W 636 nt7.69□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 PRY3YJL078C 2646 nt7.68□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 ASN2YGR124W 1719 nt7.68□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.67□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YLR123CYLR123C 330 nt7.67□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 OGG1YML060W 1131 nt7.67□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 VMA2YBR127C 1554 nt7.67□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 PEX13YLR191W 1161 nt7.66□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 RFC4YOL094C 972 nt7.66□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 CRP1YHR146W 1398 nt7.66□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YOS9YDR057W 1629 nt7.65□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 ISC1YER019W 1434 nt7.65□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 YJR146WYJR146W 354 nt7.65□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 SWD1YAR003W 1281 nt7.65□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 BUD20YLR074C 501 nt7.65□□□□□ -1.18
LSP1Q12230 NUP49YGL172W 1419 nt7.64□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.64□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 Q0010Q0010 387 nt7.64□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 YLR312CYLR312C 1197 nt7.63□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 COX10YPL172C 1389 nt7.62□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 CIS3YJL158C 684 nt7.62□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 GPI11YDR302W 660 nt7.61□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 HMS2YJR147W 1077 nt7.61□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 YNL200CYNL200C 741 nt7.61□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 VPS61YDR136C 573 nt7.6□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 DID2YKR035W-A 615 nt7.6□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 NOG2YNR053C 1461 nt7.6□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 AVT4YNL101W 2142 nt7.6□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 PUS7YOR243C 2031 nt7.59□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 IMA5YJL216C 1746 nt7.59□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 AIM24YJR080C 1185 nt7.59□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 FIT2YOR382W 462 nt7.59□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 YJL163CYJL163C 1668 nt7.59□□□□□ -1.19
LSP1Q12230 AIM46YHR199C 933 nt7.58□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 MOD5YOR274W 1287 nt7.58□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YPR076WYPR076W 375 nt7.58□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 PEX3YDR329C 1326 nt7.57□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 AGX1YFL030W 1158 nt7.57□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 TPO3YPR156C 1869 nt7.57□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 MFG1YDL233W 1377 nt7.57□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 HRQ1YDR291W 3234 nt7.56□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 RKI1YOR095C 777 nt7.56□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 DAL7YIR031C 1665 nt7.56□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 PUP2YGR253C 783 nt7.55□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 DUS4YLR405W 1104 nt7.55□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 COQ3YOL096C 939 nt7.55□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 MRPL23YOR150W 492 nt7.55□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YPL257WYPL257W 582 nt7.55□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 TPK1YJL164C 1194 nt7.54□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 BSC4YNL269W 396 nt7.54□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YOL046CYOL046C 675 nt7.54□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 KEL1YHR158C 3495 nt7.54□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 CEF1YMR213W 1773 nt7.54□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YJR154WYJR154W 1041 nt7.53□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YKL077WYKL077W 1179 nt7.53□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YKL102CYKL102C 306 nt7.53□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 SML1YML058W 315 nt7.53□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YHK8YHR048W 1545 nt7.52□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 PGM1YKL127W 1713 nt7.52□□□□□ -1.2
LSP1Q12230 YRB2YIL063C 984 nt7.52□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 PPH21YDL134C 1110 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 FAL1YDR021W 1200 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 PPM1YDR435C 987 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 BIM1YER016W 1035 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 DMA1YHR115C 1251 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 COA1YIL157C 594 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 YIR042CYIR042C 711 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 YAR064WYAR064W 300 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 LDB16YCL005W 771 nt7.5□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 EDC2YER035W 438 nt7.49□□□□□ -1.21
LSP1Q12230 QCR8YJL166W 285 nt7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms