Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 GCG1YER163C 699 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 MTR3YGR158C 753 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YSC83YHR017W 1158 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 IDP3YNL009W 1263 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 TMA46YOR091W 1038 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 MRPL23YOR150W 492 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 MDH1YKL085W 1005 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 RNH1YMR234W 1047 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 NMD5YJR132W 3147 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YHR020WYHR020W 2067 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 ATG22YCL038C 1587 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 PAC10YGR078C 600 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 ERS1YCR075C 783 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 COQ1YBR003W 1422 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 GAL83YER027C 1254 nt6.9□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YHC3YJL059W 1227 nt6.9□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 YMR252CYMR252C 405 nt6.9□□□□□ -1.3
VPS54Q12071 KIN1YDR122W 3195 nt6.9□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RGD2YFL047W 2145 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 SEC23YPR181C 2307 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 HHY1YEL059W 309 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 GPA1YHR005C 1419 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 MCH2YKL221W 1422 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 PPM2YOL141W 2088 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 EMP65YER140W 1671 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 ERG8YMR220W 1356 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 GPD2YOL059W 1323 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 POR2YIL114C 846 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 OM45YIL136W 1182 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 TSR2YLR435W 618 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 CUE4YML101C 354 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 ARC35YNR035C 1029 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YBR241CYBR241C 1467 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YRB2YIL063C 984 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YKR045CYKR045C 552 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RRN10YBL025W 438 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 IRC11YOR013W 471 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YPL136WYPL136W 369 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 HBN1YCL026C-B 582 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 SLA2YNL243W 2907 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 PRP2YNR011C 2631 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 EFM1YHL039W 1758 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 CCT3YJL014W 1605 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 STT3YGL022W 2157 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 TOS2YGR221C 1869 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 MHT1YLL062C 975 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YLR184WYLR184W 348 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 ECM30YLR436C 3825 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 ADE17YMR120C 1779 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 RGT2YDL138W 2292 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YAR064WYAR064W 300 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 SKY1YMR216C 2229 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 YHK8YHR048W 1545 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 HSM3YBR272C 1443 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 HIS1YER055C 894 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 DID2YKR035W-A 615 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS54Q12071 MIP1YOR330C 3765 nt6.84□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 CLN1YMR199W 1641 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 COX10YPL172C 1389 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 ATG36YJL185C 882 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 DRE2YKR071C 1047 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 OSW2YLR054C 2175 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 GPH1YPR160W 2709 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 TAH11YJR046W 1815 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 CYB2YML054C 1776 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 YDR187CYDR187C 519 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 FAF1YIL019W 1041 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 YBR027CYBR027C 333 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 CCT8YJL008C 1707 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 RSP5YER125W 2430 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 CDC1YDR182W 1476 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 COG1YGL223C 1254 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 HGH1YGR187C 1185 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 RFC4YOL094C 972 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 GSH1YJL101C 2037 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 GFA1YKL104C 2154 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS54Q12071 NTG1YAL015C 1200 nt6.8□□□□□ -1.32
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