Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMPCAQ10713 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMPCAQ10713 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMPCAQ10713 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.8 ms