Protein–RNA interactions for Protein: Q08957

AFT2, Iron-regulated transcriptional activator AFT2, yeastyeast

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFT2Q08957 YDR415CYDR415C 1125 nt7.3□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 YJL144WYJL144W 315 nt7.3□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 YKL102CYKL102C 306 nt7.29□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 AAD14YNL331C 1131 nt7.29□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 ADH5YBR145W 1056 nt7.29□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 YPT1YFL038C 621 nt7.28□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 MIA40YKL195W 1212 nt7.28□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 LSC1YOR142W 990 nt7.28□□□□□ -1.24
AFT2Q08957 TRR1YDR353W 960 nt7.27□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 HOC1YJR075W 1191 nt7.27□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 PLB3YOL011W 2061 nt7.27□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 EDE1YBL047C 4146 nt7.27□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.27□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 YKR032WYKR032W 315 nt7.26□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 ARP3YJR065C 1350 nt7.25□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 ATG36YJL185C 882 nt7.25□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 FBA1YKL060C 1080 nt7.25□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 PMT3YOR321W 2262 nt7.25□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 LIA1YJR070C 978 nt7.24□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 SUR7YML052W 909 nt7.24□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 YNL120CYNL120C 486 nt7.24□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 RFC4YOL094C 972 nt7.24□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 COX10YPL172C 1389 nt7.23□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 ARG81YML099C 2643 nt7.23□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 CUE4YML101C 354 nt7.23□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 MSY1YPL097W 1479 nt7.23□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 YJR146WYJR146W 354 nt7.22□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 YLR312CYLR312C 1197 nt7.22□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 COX5AYNL052W 462 nt7.22□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 MSB3YNL293W 1902 nt7.22□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 RSP5YER125W 2430 nt7.22□□□□□ -1.25
AFT2Q08957 LCL3YGL085W 825 nt7.21□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 RNH1YMR234W 1047 nt7.21□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.21□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 CYS4YGR155W 1524 nt7.21□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 ICL2YPR006C 1728 nt7.21□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 THI2YBR240C 1353 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 FMO1YHR176W 1299 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 CTF8YHR191C 402 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 SQT1YIR012W 1296 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 ASF1YJL115W 840 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 NSG2YNL156C 900 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YPL257WYPL257W 582 nt7.2□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.19□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YRB2YIL063C 984 nt7.19□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 REG2YBR050C 1017 nt7.19□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 MLS1YNL117W 1665 nt7.19□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 OGG1YML060W 1131 nt7.18□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 SES1YDR023W 1389 nt7.18□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 UTR2YEL040W 1404 nt7.18□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YHK8YHR048W 1545 nt7.17□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YGR054WYGR054W 1929 nt7.17□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 GPD1YDL022W 1176 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 FAL1YDR021W 1200 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 MRPL35YDR322W 1104 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YLR123CYLR123C 330 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YAR064WYAR064W 300 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 KSH1YNL024C-A 219 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 YHR131CYHR131C 2553 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 SAL1YNL083W 1485 nt7.16□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 CIR2YOR356W 1896 nt7.15□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 RPP1YHR062C 882 nt7.15□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 GPD2YOL059W 1323 nt7.15□□□□□ -1.26
AFT2Q08957 CCT8YJL008C 1707 nt7.15□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 ARE2YNR019W 1929 nt7.15□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 CCC2YDR270W 3015 nt7.14□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 SKY1YMR216C 2229 nt7.14□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 ADE2YOR128C 1716 nt7.13□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 CTF19YPL018W 1110 nt7.13□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 EDC3YEL015W 1656 nt7.12□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 VMA3YEL027W 483 nt7.12□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 LYS1YIR034C 1122 nt7.12□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 YKR045CYKR045C 552 nt7.12□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 TAF9YMR236W 474 nt7.12□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 MDE1YJR024C 735 nt7.11□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 SRL2YLR082C 1179 nt7.11□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 MSO1YNR049C 633 nt7.11□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 AIM24YJR080C 1185 nt7.1□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 TSR2YLR435W 618 nt7.1□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 MRPS18YNL306W 654 nt7.1□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 LDB16YCL005W 771 nt7.1□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 ILV6YCL009C 930 nt7.1□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 CCR4YAL021C 2514 nt7.09□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 GCG1YER163C 699 nt7.09□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 MHT1YLL062C 975 nt7.09□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 COQ3YOL096C 939 nt7.09□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 GLN3YER040W 2193 nt7.09□□□□□ -1.27
AFT2Q08957 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.08□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 RKI1YOR095C 777 nt7.08□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 PTC4YBR125C 1182 nt7.08□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 AIM33YML087C 939 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 GTO3YMR251W 1101 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 PHO3YBR092C 1404 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 RTG2YGL252C 1767 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 SNU66YOR308C 1764 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 ECM10YEL030W 1935 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 CRP1YHR146W 1398 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 ERG8YMR220W 1356 nt7.07□□□□□ -1.28
AFT2Q08957 CBK1YNL161W 2271 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.7 ms