Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 IES1YFL013C 2079 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 HXT9YJL219W 1704 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 PAP1YKR002W 1707 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 HAC1YFL031W 717 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 GCV3YAL044C 513 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 SPE4YLR146C 903 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 YDL023CYDL023C 321 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 YDL129WYDL129W 876 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 PCL9YDL179W 915 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RMD5YDR255C 1266 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 PCL6YER059W 1263 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 GTO1YGR154C 1071 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 DFR1YOR236W 636 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RDL2YOR286W 450 nt6.9□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 MEP1YGR121C 1479 nt6.9□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 MSS116YDR194C 1995 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PUP3YER094C 618 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PIH1YHR034C 1035 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 UBC12YLR306W 567 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 HAL1YPR005C 885 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 SPO77YLR341W 1434 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YDR132CYDR132C 1488 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 SAL1YNL083W 1485 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 IMA2YOL157C 1770 nt6.89□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 BRN1YBL097W 2265 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 TIF3YPR163C 1311 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PAF1YBR279W 1338 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 IMG2YCR071C 441 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 SRG1SRG1 551 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 TPK1YJL164C 1194 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 RRP40YOL142W 723 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 ODC2YOR222W 924 nt6.88□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 MET13YGL125W 1803 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 RAM1YDL090C 1296 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 DOC1YGL240W 753 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 ARC19YKL013C 516 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 APT1YML022W 564 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PPA2YMR267W 933 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YNL140CYNL140C 570 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PRE10YOR362C 867 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PEX34YCL056C 435 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 ASN1YPR145W 1719 nt6.87□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 THI73YLR004C 1572 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 CHL4YDR254W 1377 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YDL241WYDL241W 372 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YJL144WYJL144W 315 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 SNF7YLR025W 723 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YOX1YML027W 1158 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YNL228WYNL228W 777 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YOL024WYOL024W 519 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YOR111WYOR111W 699 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 TRP5YGL026C 2124 nt6.86□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 SRP101YDR292C 1866 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 TIM50YPL063W 1431 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YDL157CYDL157C 357 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 VAM3YOR106W 852 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YPL264CYPL264C 1062 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 INO1YJL153C 1602 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 PNS1YOR161C 1620 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 RCK1YGL158W 1539 nt6.85□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 LSM6YDR378C 261 nt6.84□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 GLY1YEL046C 1164 nt6.84□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 MRPL25YGR076C 474 nt6.84□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.84□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 WSC4YHL028W 1818 nt6.84□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 YEF1YEL041W 1488 nt6.84□□□□□ -1.31
SRP1Q02821 CTF18YMR078C 2226 nt6.84□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 CLB5YPR120C 1308 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 ALT2YDR111C 1524 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 PPT1YGR123C 1542 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 MCM21YDR318W 1107 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 COX3Q0275 810 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 TDA4YJR116W 840 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 SRY1YKL218C 981 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 DIA1YMR316W 1011 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 YGP1YNL160W 1065 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 IRC11YOR013W 471 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 ISA2YPR067W 558 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 JHD1YER051W 1479 nt6.83□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 CIT2YCR005C 1383 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 IVY1YDR229W 1362 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 ATG18YFR021W 1503 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 SPG1YGR236C 288 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 YHR022CYHR022C 771 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 MHO1YJR008W 1017 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 ATP23YNR020C 813 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 DSC2YOL073C 969 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 MRN1YPL184C 1839 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 PCS60YBR222C 1632 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 LAG2YOL025W 1983 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 MST1YKL194C 1389 nt6.82□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 HXK2YGL253W 1461 nt6.81□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 SGF73YGL066W 1974 nt6.81□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 AI3Q0060 1248 nt6.81□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 DUG1YFR044C 1446 nt6.8□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.8□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 RRT7YLL030C 342 nt6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.5 ms