Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGCS1Q01581 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGCS1Q01581 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms