Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A2Q01362 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A2Q01362 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A2Q01362 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A2Q01362 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms