Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSNK2BP67870 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSNK2BP67870 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms