Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2FP61218 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR2FP61218 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2FP61218 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2FP61218 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms