Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM11AP58511 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM11AP58511 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM11AP58511 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168 ms