Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBASH3AP57075 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBASH3AP57075 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBASH3AP57075 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBASH3AP57075 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms