Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATXN1P54253 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATXN1P54253 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN1P54253 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATXN1P54253 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATXN1P54253 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms